Plateforme GeT-Biopuces

GeT-Biopuces

Plateforme TBI de génomique et transcriptomique.
Séquençage et microarrays.

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2022

Aboulela, Amr, Matthieu Peyre Lavigne, Tony Pons, Mansour Bounouba, Maud Schiettekatte, Pascale Lepercq, Myriam Mercade, Cédric Patapy, Samuel Meulenyzer, and Alexandra Bertron. 2022. “The Fate of Tetrathionate during the Development of a Biofilm in Biogenic Sulfuric Acid Attack on Different Cementitious Materials.” Science of The Total Environment 850 (December): 158031. doi:https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.158031.

Fournier, Elora, Sylvain Denis, Alessandra Dominicis, Tom Van de Wiele, Monique Alric, Muriel Mercier-Bonin, Lucie Etienne-Mesmin, and Stéphanie Blanquet-Diot. 2022. “A Child Is Not an Adult: Development of a New in Vitro Model of the Toddler Colon.” Applied Microbiology and Biotechnology 106 (21): 7315–36. doi:https://doi.org/10.1007/s00253-022-12199-0.

Frétin, Marie, Amaury Gérard, Anne Ferlay, Bruno Martin, Solange Buchin, Sébastien Theil, Etienne Rifa, et al. 2022. “Integration of Multiomic Data to Characterize the Influence of Milk Fat Composition on Cantal-Type Cheese Microbiota.” Microorganisms 10 (2): 334. doi:https://doi.org/10.3390/microorganisms10020334.

Laguillaumie, Léa, Yan Rafrafi, Elisabeth Moya-Leclair, Delphine Delagnes, Simon Dubos, Mathieu Spérandio, Etienne Paul, and Claire Dumas. 2022. “Stability of Ex Situ Biological Methanation of H2/CO2 with a Mixed Microbial Culture in a Pilot Scale Bubble Column Reactor.” Bioresource Technology 354 (June): 127180. doi:https://doi.org/10.1016/j.biortech.2022.127180.

Laroute, Valérie, Catherine Beaufrand, Pedro Gomes, Sébastien Nouaille, Valérie Tondereau, Marie-Line Daveran-Mingot, Vassilia Theodorou, Hélène Eutamene, Muriel Mercier-Bonin, and Muriel Cocaign-Bousquet. 2022. “Lactococcus Lactis NCDO2118 Exerts Visceral Antinociceptive Properties in Rat via GABA Production in the Gastro-Intestinal Tract.” Edited by Gisela Storz. ELife 11 (June): e77100. doi:https://doi.org/10.7554/eLife.77100.

Nguyen, Huong Le, Marie-Pierre Duviau, Sandrine Laguerre, Sébastien Nouaille, Muriel Cocaign-Bousquet, and Laurence Girbal. 2022. “Synergistic Regulation of Transcription and Translation in Escherichia Coli Revealed by Codirectional Increases in MRNA Concentration and Translation Efficiency.” Microbiology Spectrum 10 (1): e0204121. doi:https://doi.org/10.1128/spectrum.02041-21.

Pregnon, Guillaume, Nigel P. Minton, and Philippe Soucaille. 2022. “Genome Sequence of Eubacterium Limosum B2 and Evolution for Growth on a Mineral Medium with Methanol and CO2 as Sole Carbon Sources.” Microorganisms 10 (9): 1790. doi:https://doi.org/10.3390/microorganisms10091790.

Verdier-Metz, Isabelle, Céline Delbès, Matthieu Bouchon, Philippe Pradel, Sébastien Theil, Etienne Rifa, Agnès Corbin, and Christophe Chassard. 2022. “Influence of Post-Milking Treatment on Microbial Diversity on the Cow Teat Skin and in Milk.” Dairy 3 (2): 262–76. doi:https://doi.org/10.3390/dairy3020021.

2021

Piqueras, Justine, Christophe Chassard, Cécile Callon, Etienne Rifa, Sébastien Theil, Annick Lebecque, et Céline Delbès. « Lactic Starter Dose Shapes S. Aureus and STEC O26:H11 Growth, and Bacterial Community Patterns in Raw Milk Uncooked Pressed Cheeses ». Microorganisms 9, nᵒ 5 (mai 2021): 1081. doi:10.3390/microorganisms9051081.

Paccoud, Romain, Céline Saint-Laurent, Enzo Piccolo, Mylène Tajan, Alizée Dortignac, Ophélie Pereira, Sophie Le Gonidec, et al. « SHP2 Drives Inflammation-Triggered Insulin Resistance by Reshaping Tissue Macrophage Populations ». Science Translational Medicine 13, nᵒ 591 (28 avril 2021). doi:10.1126/scitranslmed.abe2587.

Millard, Pierre, Brice Enjalbert, Sandrine Uttenweiler-Joseph, Jean-Charles Portais, et Fabien Létisse. « Control and regulation of acetate overflow in Escherichia coli ». Édité par Michael Doebeli et Naama Barkai. eLife 10 (15 mars 2021): e63661. doi:10.7554/eLife.63661.

Arnould, Coline, Vincent Rocher, Anne-Laure Finoux, Thomas Clouaire, Kevin Li, Felix Zhou, Pierre Caron, et al. « Loop Extrusion as a Mechanism for Formation of DNA Damage Repair Foci ». Nature 590, nᵒ 7847 (février 2021): 660‑65. doi:10.1038/s41586-021-03193-z.

Courtot, Lilas, Elodie Bournique, Chrystelle Maric, Laure Guitton-Sert, Miguel Madrid-Mencía, Vera Pancaldi, Jean-Charles Cadoret, Jean-Sébastien Hoffmann, et Valérie Bergoglio. « Low Replicative Stress Triggers Cell-Type Specific Inheritable Advanced Replication Timing ». International Journal of Molecular Sciences 22, nᵒ 9 (janvier 2021): 4959. doi:10.3390/ijms22094959.

2020

Pavlovic, Marion, Christelle Gross, Chahinaize Chili, Thomas Secher, et Emmanuel Treiner. « MAIT Cells Display a Specific Response to Type 1 IFN Underlying the Adjuvant Effect of TLR7/8 Ligands ». Frontiers in Immunology 11 (8 septembre 2020): 2097. doi:10.3389/fimmu.2020.02097.

Tauzin, Alexandra S., Mariana Rangel Pereira, Liisa D. Van Vliet, Pierre-Yves Colin, Elisabeth Laville, Jeremy Esque, Sandrine Laguerre, et al. « Investigating Host-Microbiome Interactions by Droplet Based Microfluidics ». Microbiome 8, nᵒ 1 (décembre 2020): 141. doi:10.1186/s40168-020-00911-z.

Bertorello, Juliette, Julie Sesen, Julia Gilhodes, Solène Evrard, Monique Courtade-Saïdi, Meera Augustus, Emmanuelle Uro-Coste, et al. « Translation Reprogramming by EIF3 Linked to Glioblastoma Resistance ». NAR Cancer 2, nᵒ 3 (1 septembre 2020): zcaa020. doi:10.1093/narcan/zcaa020.

De Simone, A., C. M. Vicente, C. Peiro, L. Gales, F. Bellvert, B. Enjalbert, et S. Heux. « Mixing and Matching Methylotrophic Enzymes to Design a Novel Methanol Utilization Pathway in E. Coli ». Metabolic Engineering 61 (1 septembre 2020): 315‑25. doi:10.1016/j.ymben.2020.07.005.

Morin, Manon, Brice Enjalbert, Delphine Ropers, Laurence Girbal, et Muriel Cocaign-Bousquet. « Genomewide Stabilization of MRNA during a “Feast-to-Famine” Growth Transition in Escherichia Coli ». Édité par Craig D. Ellermeier. MSphere 5, nᵒ 3 (20 mai 2020): e00276-20, /msphere/5/3/mSphere276-20.atom. doi:10.1128/mSphere.00276-20.

Wang, Zhi, Alexandra S. Tauzin, Elisabeth Laville, Pietro Tedesco, Fabien Létisse, Nicolas Terrapon, Pascale Lepercq, Myriam Mercade, et Gabrielle Potocki-Veronese. « Harvesting of Prebiotic Fructooligosaccharides by Nonbeneficial Human Gut Bacteria ». Édité par Vincent B. Young. MSphere 5, nᵒ 1 (8 janvier 2020): e00771-19, /msphere/5/1/mSphere771-19.atom. doi:10.1128/mSphere.00771-19.

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Biologiste
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Etienne Rifa Analyses Métagénomique ciblée RNAseq, GenomeSeq

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Jean-Luc Parrou R&D Développement de méthodes

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